El Programa de Postgrado en Antropología entrega el grado de Magíster y/o Doctor en Antropología y está orientado a formar nuevas generaciones de antropólogos, a través de estudios avanzados en las disciplinas que conforman este campo de las ciencias sociales. Es un programa de formación general en las ciencias antropológicas con especial interés por temáticas andinas. Se dirige a la formación de investigadores, docentes y profesionales de las ciencias antropológicas, para un desempeño de alta calidad en universidades, centros de investigación y organismos estatales y privados.
Es un programa presencial con énfasis en la investigación científica, sustentada en la fuerza y trayectoria de las instituciones que lo imparten, en los campos de la arqueología, antropología social, bioantropología y etnohistoria. Se realiza mediante la cooperación entre dos de los centros de antropología más activos del norte de Chile: el Instituto de Investigaciones Arqueológicas y Museo de la Universidad Católica del Norte (UCN) en San Pedro de Atacama y el Departamento de Antropología de la Universidad de Tarapacá (UTA) y su Museo en San Miguel de Azapa, Arica. Se imparte con la concurrencia de sus académicos y de especialistas nacionales y extranjeros.
Las unidades académicas que integran el Programa cuentan con una trayectoria de más de cuarenta años de investigación arqueológica y antropológica, siendo consideradas instituciones de referencia para investigadores nacionales y extranjeros. Presentan una destacada y reconocida productividad académica, reflejada en sus índices de aprobación de proyectos de investigación (Fondecyt e internacionales), sus publicaciones (libros y artículos en revistas indizadas o de corriente principal) y la participación y organización de eventos con convocatoria internacional. Aparte de los proyectos y publicaciones generadas, estas unidades editan dos de las revistas más importantes de la antropología chilena y surandina: Chungara: Revista de Antropología Chilena de la UTA y Estudios Atacameños: Arqueología y Antropología Surandina de la UCN (ambas indizadas en ISI). La edición de estas revistas ofrece una oportunidad académica adicional a los estudiantes del Postgrado interesados en conseguir una experiencia editorial (publicar; o trabajar en evaluaciones de artículos). De este modo, el Programa se inscribe en un ambiente científico dinámico, con numerosas vinculaciones nacionales e internacionales disponibles para ser utilizadas por los participantes del Programa.
El espacio de cobertura del Programa envuelve una extensa gama de problemas científicos de la antropología y arqueología. Todos ellos gozan de una amplia acogida e interés en medios académicos nacionales e internacionales y más allá de la propia antropología. Por ejemplo, la relación entre culturas y ambientes desérticos y de alta montaña, los procesos de integración social en diversas escalas de organización, la existencia de procesos de continuidad y cambio cultural de larga duración, los fenómenos étnicos de la modernidad andina; las continuidades y transformaciones culturales que rebasan las fronteras nacionales; los sujetos sociales de ayer y hoy en sus relaciones regionales, etc. Consecuentemente, junto con recibir una formación antropológica avanzada, los alumnos podrán encontrar en el Programa la posibilidad de integrarse en la investigación antropológica o arqueológica en curso y ganar allí experiencia, sustentada en la riqueza de cultura material pre y post-hispánica y en la diversidad de fenómenos sociales de interés que ofrece la macro región norte de Chile y sus áreas vecinas.
De esta manera, la creación de un centro de formación de postgrado e investigación en Antropología interesado en temáticas históricas y sociales de amplia distribución es también un modo de integración subregional. Las cuestiones que conciernen a la antropología de estas latitudes son en diversos aspectos también compartidas por las áreas vecinas de los países limítrofes. El postgrado y las unidades académicas que lo impulsan pueden así convertirse en un punto de convergencia entre el sur del Perú, el altiplano de Bolivia, el noroeste argentino y norte de Chile. Aspiramos de esta manera, estimular una "vocación surandina" compartida por investigadores, alumnos e instituciones relacionadas.
La presencia en el Programa de investigadores extranjeros especialistas, de profesores invitados de países vecinos y la incorporación de estudiantes de esos mismos países, permite crear un ambiente académico multinacional. Se abren así posibilidades de realizar acciones y proyectos académicos de colaboración en materia editorial, de investigación comparativa o subregional y de intercambio.
El Programa de Doctorado en Antropología ha obtenido recientemente su reacreditación por la CNA, mientras que el Magíster, reacreditado en el año 2005, está tramitando su segunda reacreditación.
La creación de este Doctorado ha sido apoyada por MECESUP (programa de mejoramiento de la educación superior, dependiente del Ministerio de Educación de la República de Chile), lo que ha permitido:

• Elaborar un programa que cumple exigencias internacionales de calidad, en cuyo diseño y validación han participado destacados académicos de universidades americanas y europeas.
• Disponer de un claustro de profesores apropiado en número y calidad a las exigencias de un programa de excelencia, mediante la contratación de nuevos docentes de destacada productividad científica, el perfeccionamiento posdoctoral de sus miembros y la posibilidad de contar con connotados académicos nacionales y extranjeros como profesores visitantes.
• Mejorar y modernizar los procesos de enseñanza-aprendizaje a través de la ampliación de infraestructura de docencia, en laboratorios y cubículos para los alumnos, renovación de instrumentos, equipos y software e incorporación de tecnología de la información como recurso pedagógico.