El Departamento de Administración surge al interior de la Facultad de Economía y Administración (FACEA), cuyos orígenes se remontan a la creación de la carrera de Contador Auditor – Contador Público en 1968 y cuatro años más tarde de la carrera de Ingeniería Comercial.
El 8 de Marzo de 1969 se crea el Departamento de Ciencias Económicas, que en Octubre de 1974 pasa a denominarse Departamento de Planificación. La Facultad propiamente tal se crea según Decreto 1006/82, el 20 de diciembre de 1982, denominándose Facultad de Economía, y la integran los Departamentos de Economía y Administración y de Comunicación Social.
A contar del día 1 de marzo de 1983, cambia la denominación del Departamento de Economía y Administración por el de Administración y Economía, al que queda adscrita la carrera de Ingeniería Comercial. En 1989, se vuelve a reestructurar la unidad, mediante Decreto N°1623/89, quedando establecida la separación de sus unidades de la siguiente forma: Departamento de Administración y Departamento de Economía.
El 29 de julio de 1994, a través del Decreto N°71/94, se aprueba la reestructuración de la Facultad de Economía de la Universidad Católica del Norte. Así, a contar del 1 de agosto de 1994, se cierran los Departamentos de Administración y Ciencias Contables y se reemplazan por el Departamento de Ciencias Empresariales, cuyo objetivo es desarrollar docencia, investigación y extensión en áreas temáticas relacionadas con los asuntos empresariales.
En 1998, toma el nombre de Facultad de Economía y Administración impartiendo las carreras de Ingeniería Comercial y Contador Auditor – Contador Público.
Luego en septiembre del año 2008 según Decreto 82/2008, se realiza una nueva modificación a la FACEA, separando el Departamento de Ciencias Empresariales y creando las actuales unidades: Departamento de Administración, y Departamento de Auditoría, Contabilidad y Control de Gestión.
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